Protein–RNA interactions for Protein: P20062

TCN2, Transcobalamin-2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN2P20062 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCN2P20062 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCN2P20062 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCN2P20062 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCN2P20062 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCN2P20062 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCN2P20062 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCN2P20062 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCN2P20062 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCN2P20062 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCN2P20062 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TCN2P20062 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCN2P20062 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCN2P20062 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCN2P20062 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCN2P20062 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TCN2P20062 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCN2P20062 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCN2P20062 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCN2P20062 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCN2P20062 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCN2P20062 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCN2P20062 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCN2P20062 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCN2P20062 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCN2P20062 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCN2P20062 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCN2P20062 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TCN2P20062 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCN2P20062 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCN2P20062 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCN2P20062 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCN2P20062 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCN2P20062 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCN2P20062 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCN2P20062 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCN2P20062 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCN2P20062 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCN2P20062 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCN2P20062 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCN2P20062 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCN2P20062 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCN2P20062 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCN2P20062 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TCN2P20062 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCN2P20062 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCN2P20062 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCN2P20062 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCN2P20062 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCN2P20062 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCN2P20062 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TCN2P20062 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCN2P20062 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TCN2P20062 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCN2P20062 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCN2P20062 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCN2P20062 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCN2P20062 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCN2P20062 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCN2P20062 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCN2P20062 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCN2P20062 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCN2P20062 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCN2P20062 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCN2P20062 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCN2P20062 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCN2P20062 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCN2P20062 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TCN2P20062 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TCN2P20062 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCN2P20062 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCN2P20062 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCN2P20062 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCN2P20062 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TCN2P20062 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCN2P20062 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCN2P20062 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCN2P20062 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCN2P20062 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TCN2P20062 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCN2P20062 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCN2P20062 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCN2P20062 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCN2P20062 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCN2P20062 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCN2P20062 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCN2P20062 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCN2P20062 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCN2P20062 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCN2P20062 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCN2P20062 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCN2P20062 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCN2P20062 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCN2P20062 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCN2P20062 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCN2P20062 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCN2P20062 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCN2P20062 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCN2P20062 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCN2P20062 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms