Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT15P19012 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT15P19012 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT15P19012 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT15P19012 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT15P19012 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT15P19012 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT15P19012 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT15P19012 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT15P19012 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT15P19012 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT15P19012 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT15P19012 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT15P19012 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT15P19012 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT15P19012 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT15P19012 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT15P19012 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT15P19012 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT15P19012 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT15P19012 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT15P19012 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT15P19012 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT15P19012 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT15P19012 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT15P19012 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT15P19012 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT15P19012 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT15P19012 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT15P19012 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT15P19012 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT15P19012 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT15P19012 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT15P19012 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT15P19012 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT15P19012 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT15P19012 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT15P19012 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT15P19012 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT15P19012 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT15P19012 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT15P19012 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT15P19012 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT15P19012 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT15P19012 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT15P19012 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT15P19012 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT15P19012 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT15P19012 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT15P19012 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT15P19012 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT15P19012 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT15P19012 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT15P19012 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT15P19012 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT15P19012 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT15P19012 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT15P19012 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT15P19012 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT15P19012 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT15P19012 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT15P19012 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT15P19012 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT15P19012 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT15P19012 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT15P19012 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT15P19012 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT15P19012 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT15P19012 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT15P19012 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT15P19012 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT15P19012 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT15P19012 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT15P19012 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT15P19012 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT15P19012 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT15P19012 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT15P19012 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT15P19012 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT15P19012 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT15P19012 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT15P19012 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT15P19012 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT15P19012 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT15P19012 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT15P19012 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT15P19012 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT15P19012 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT15P19012 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT15P19012 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT15P19012 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT15P19012 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT15P19012 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT15P19012 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT15P19012 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT15P19012 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT15P19012 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KRT15P19012 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT15P19012 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT15P19012 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms