Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA1P17302 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA1P17302 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA1P17302 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA1P17302 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA1P17302 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA1P17302 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA1P17302 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA1P17302 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA1P17302 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA1P17302 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA1P17302 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA1P17302 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA1P17302 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA1P17302 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA1P17302 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA1P17302 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA1P17302 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA1P17302 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA1P17302 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA1P17302 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA1P17302 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA1P17302 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA1P17302 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA1P17302 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA1P17302 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA1P17302 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA1P17302 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GJA1P17302 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA1P17302 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA1P17302 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA1P17302 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA1P17302 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA1P17302 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA1P17302 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA1P17302 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA1P17302 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA1P17302 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA1P17302 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA1P17302 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJA1P17302 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJA1P17302 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA1P17302 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA1P17302 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA1P17302 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA1P17302 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJA1P17302 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA1P17302 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA1P17302 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA1P17302 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GJA1P17302 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA1P17302 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJA1P17302 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJA1P17302 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA1P17302 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA1P17302 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJA1P17302 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJA1P17302 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJA1P17302 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJA1P17302 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJA1P17302 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA1P17302 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA1P17302 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA1P17302 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA1P17302 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA1P17302 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA1P17302 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA1P17302 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA1P17302 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA1P17302 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA1P17302 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA1P17302 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA1P17302 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJA1P17302 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJA1P17302 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJA1P17302 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJA1P17302 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJA1P17302 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJA1P17302 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJA1P17302 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJA1P17302 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA1P17302 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GJA1P17302 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA1P17302 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA1P17302 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA1P17302 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA1P17302 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA1P17302 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA1P17302 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA1P17302 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA1P17302 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA1P17302 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA1P17302 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA1P17302 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA1P17302 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA1P17302 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA1P17302 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA1P17302 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA1P17302 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA1P17302 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms