Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAG1P15918 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAG1P15918 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RAG1P15918 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAG1P15918 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RAG1P15918 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAG1P15918 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAG1P15918 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAG1P15918 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RAG1P15918 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAG1P15918 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAG1P15918 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAG1P15918 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAG1P15918 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAG1P15918 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAG1P15918 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAG1P15918 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAG1P15918 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAG1P15918 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAG1P15918 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAG1P15918 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAG1P15918 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAG1P15918 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAG1P15918 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAG1P15918 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAG1P15918 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAG1P15918 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAG1P15918 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RAG1P15918 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RAG1P15918 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RAG1P15918 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAG1P15918 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAG1P15918 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAG1P15918 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAG1P15918 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAG1P15918 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAG1P15918 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAG1P15918 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAG1P15918 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RAG1P15918 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAG1P15918 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAG1P15918 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAG1P15918 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAG1P15918 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAG1P15918 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAG1P15918 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAG1P15918 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAG1P15918 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAG1P15918 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAG1P15918 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAG1P15918 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAG1P15918 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAG1P15918 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAG1P15918 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAG1P15918 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAG1P15918 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAG1P15918 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAG1P15918 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAG1P15918 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAG1P15918 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAG1P15918 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAG1P15918 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAG1P15918 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAG1P15918 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAG1P15918 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAG1P15918 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAG1P15918 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAG1P15918 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAG1P15918 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAG1P15918 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAG1P15918 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAG1P15918 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAG1P15918 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAG1P15918 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAG1P15918 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAG1P15918 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAG1P15918 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAG1P15918 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAG1P15918 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAG1P15918 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAG1P15918 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAG1P15918 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAG1P15918 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RAG1P15918 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAG1P15918 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAG1P15918 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAG1P15918 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAG1P15918 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAG1P15918 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAG1P15918 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAG1P15918 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAG1P15918 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAG1P15918 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAG1P15918 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAG1P15918 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAG1P15918 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAG1P15918 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAG1P15918 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAG1P15918 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RAG1P15918 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms