Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxc6P10629 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hoxc6P10629 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hoxc6P10629 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hoxc6P10629 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hoxc6P10629 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hoxc6P10629 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Hoxc6P10629 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxc6P10629 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hoxc6P10629 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Hoxc6P10629 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxc6P10629 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxc6P10629 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxc6P10629 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxc6P10629 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxc6P10629 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Hoxc6P10629 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxc6P10629 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxc6P10629 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxc6P10629 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxc6P10629 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxc6P10629 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxc6P10629 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxc6P10629 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxc6P10629 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxc6P10629 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxc6P10629 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxc6P10629 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxc6P10629 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hoxc6P10629 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hoxc6P10629 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxc6P10629 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxc6P10629 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxc6P10629 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxc6P10629 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hoxc6P10629 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxc6P10629 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxc6P10629 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxc6P10629 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxc6P10629 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxc6P10629 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxc6P10629 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxc6P10629 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxc6P10629 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxc6P10629 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxc6P10629 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxc6P10629 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxc6P10629 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxc6P10629 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxc6P10629 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxc6P10629 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxc6P10629 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxc6P10629 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hoxc6P10629 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxc6P10629 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxc6P10629 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxc6P10629 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hoxc6P10629 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxc6P10629 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxc6P10629 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxc6P10629 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hoxc6P10629 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxc6P10629 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxc6P10629 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxc6P10629 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxc6P10629 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxc6P10629 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hoxc6P10629 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxc6P10629 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxc6P10629 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxc6P10629 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxc6P10629 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxc6P10629 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxc6P10629 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxc6P10629 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxc6P10629 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxc6P10629 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxc6P10629 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxc6P10629 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxc6P10629 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxc6P10629 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hoxc6P10629 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hoxc6P10629 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxc6P10629 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxc6P10629 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxc6P10629 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxc6P10629 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxc6P10629 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxc6P10629 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxc6P10629 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxc6P10629 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc6P10629 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc6P10629 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc6P10629 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc6P10629 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxc6P10629 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxc6P10629 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxc6P10629 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxc6P10629 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxc6P10629 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms