Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP1A1P05023 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP1A1P05023 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP1A1P05023 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP1A1P05023 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP1A1P05023 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP1A1P05023 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP1A1P05023 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP1A1P05023 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP1A1P05023 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP1A1P05023 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP1A1P05023 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP1A1P05023 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP1A1P05023 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP1A1P05023 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP1A1P05023 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP1A1P05023 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP1A1P05023 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP1A1P05023 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP1A1P05023 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP1A1P05023 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP1A1P05023 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP1A1P05023 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP1A1P05023 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP1A1P05023 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP1A1P05023 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP1A1P05023 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP1A1P05023 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP1A1P05023 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP1A1P05023 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP1A1P05023 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP1A1P05023 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP1A1P05023 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP1A1P05023 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP1A1P05023 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP1A1P05023 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP1A1P05023 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP1A1P05023 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP1A1P05023 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP1A1P05023 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP1A1P05023 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP1A1P05023 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP1A1P05023 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP1A1P05023 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP1A1P05023 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP1A1P05023 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP1A1P05023 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP1A1P05023 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP1A1P05023 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP1A1P05023 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP1A1P05023 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ATP1A1P05023 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP1A1P05023 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1A1P05023 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1A1P05023 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1A1P05023 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1A1P05023 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1A1P05023 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATP1A1P05023 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATP1A1P05023 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1A1P05023 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1A1P05023 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1A1P05023 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATP1A1P05023 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1A1P05023 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1A1P05023 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1A1P05023 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1A1P05023 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1A1P05023 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1A1P05023 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1A1P05023 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms