Protein–RNA interactions for Protein: P01906

HLA-DQA2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA2P01906 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DQA2P01906 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DQA2P01906 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DQA2P01906 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-DQA2P01906 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-DQA2P01906 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-DQA2P01906 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-DQA2P01906 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-DQA2P01906 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-DQA2P01906 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DQA2P01906 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DQA2P01906 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DQA2P01906 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DQA2P01906 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DQA2P01906 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DQA2P01906 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DQA2P01906 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DQA2P01906 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DQA2P01906 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-DQA2P01906 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DQA2P01906 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms