Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINA3P01011 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINA3P01011 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINA3P01011 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINA3P01011 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINA3P01011 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINA3P01011 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SERPINA3P01011 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERPINA3P01011 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINA3P01011 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINA3P01011 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINA3P01011 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINA3P01011 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA3P01011 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA3P01011 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINA3P01011 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINA3P01011 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINA3P01011 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINA3P01011 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINA3P01011 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINA3P01011 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINA3P01011 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINA3P01011 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA3P01011 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms