Protein–RNA interactions for Protein: O95996

APC2, Adenomatous polyposis coli protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APC2O95996 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APC2O95996 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APC2O95996 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APC2O95996 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APC2O95996 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APC2O95996 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APC2O95996 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APC2O95996 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APC2O95996 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APC2O95996 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APC2O95996 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
APC2O95996 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
APC2O95996 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APC2O95996 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APC2O95996 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APC2O95996 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APC2O95996 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APC2O95996 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APC2O95996 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APC2O95996 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APC2O95996 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APC2O95996 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APC2O95996 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
APC2O95996 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APC2O95996 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APC2O95996 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APC2O95996 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APC2O95996 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APC2O95996 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APC2O95996 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APC2O95996 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APC2O95996 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APC2O95996 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APC2O95996 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APC2O95996 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APC2O95996 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APC2O95996 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APC2O95996 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APC2O95996 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APC2O95996 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APC2O95996 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APC2O95996 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APC2O95996 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APC2O95996 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APC2O95996 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APC2O95996 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APC2O95996 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APC2O95996 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APC2O95996 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APC2O95996 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APC2O95996 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APC2O95996 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APC2O95996 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APC2O95996 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APC2O95996 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APC2O95996 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APC2O95996 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APC2O95996 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APC2O95996 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APC2O95996 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APC2O95996 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APC2O95996 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APC2O95996 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APC2O95996 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APC2O95996 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APC2O95996 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APC2O95996 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APC2O95996 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APC2O95996 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APC2O95996 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APC2O95996 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APC2O95996 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
APC2O95996 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APC2O95996 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APC2O95996 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APC2O95996 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APC2O95996 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APC2O95996 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APC2O95996 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APC2O95996 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APC2O95996 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APC2O95996 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APC2O95996 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APC2O95996 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APC2O95996 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APC2O95996 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APC2O95996 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APC2O95996 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APC2O95996 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APC2O95996 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APC2O95996 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APC2O95996 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APC2O95996 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APC2O95996 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APC2O95996 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APC2O95996 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APC2O95996 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APC2O95996 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
APC2O95996 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
APC2O95996 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms