Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF12O95522 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF12O95522 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF12O95522 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF12O95522 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF12O95522 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF12O95522 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF12O95522 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF12O95522 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF12O95522 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF12O95522 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF12O95522 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF12O95522 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF12O95522 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF12O95522 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF12O95522 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF12O95522 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF12O95522 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF12O95522 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF12O95522 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF12O95522 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF12O95522 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF12O95522 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF12O95522 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF12O95522 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF12O95522 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF12O95522 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF12O95522 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF12O95522 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF12O95522 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF12O95522 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF12O95522 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF12O95522 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF12O95522 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF12O95522 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF12O95522 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF12O95522 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF12O95522 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF12O95522 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF12O95522 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF12O95522 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF12O95522 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF12O95522 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF12O95522 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF12O95522 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF12O95522 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF12O95522 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF12O95522 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF12O95522 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF12O95522 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF12O95522 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF12O95522 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF12O95522 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF12O95522 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF12O95522 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF12O95522 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF12O95522 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF12O95522 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF12O95522 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF12O95522 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF12O95522 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF12O95522 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF12O95522 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF12O95522 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF12O95522 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF12O95522 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF12O95522 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF12O95522 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF12O95522 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF12O95522 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF12O95522 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF12O95522 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF12O95522 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF12O95522 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF12O95522 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF12O95522 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF12O95522 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF12O95522 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF12O95522 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF12O95522 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF12O95522 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF12O95522 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms