Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
PCF11O94913 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
PCF11O94913 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
PCF11O94913 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
PCF11O94913 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
PCF11O94913 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
PCF11O94913 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
PCF11O94913 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
PCF11O94913 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
PCF11O94913 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
PCF11O94913 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
PCF11O94913 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.4■■■■■ 4.38
PCF11O94913 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
PCF11O94913 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
PCF11O94913 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
PCF11O94913 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
PCF11O94913 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
PCF11O94913 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
PCF11O94913 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
PCF11O94913 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
PCF11O94913 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
PCF11O94913 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
PCF11O94913 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
PCF11O94913 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
PCF11O94913 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
PCF11O94913 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
PCF11O94913 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
PCF11O94913 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.27■■■■■ 4.36
PCF11O94913 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
PCF11O94913 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC42.26■■■■■ 4.36
PCF11O94913 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
PCF11O94913 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
PCF11O94913 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
PCF11O94913 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
PCF11O94913 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
PCF11O94913 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
PCF11O94913 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
PCF11O94913 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
PCF11O94913 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
PCF11O94913 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
PCF11O94913 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
PCF11O94913 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
PCF11O94913 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
PCF11O94913 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
PCF11O94913 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
PCF11O94913 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
PCF11O94913 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
PCF11O94913 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
PCF11O94913 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
PCF11O94913 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
PCF11O94913 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
PCF11O94913 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
PCF11O94913 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
PCF11O94913 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
PCF11O94913 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PCF11O94913 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
PCF11O94913 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
PCF11O94913 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.11■■■■■ 4.33
PCF11O94913 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
PCF11O94913 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
PCF11O94913 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
PCF11O94913 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
PCF11O94913 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
PCF11O94913 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
PCF11O94913 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
PCF11O94913 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
PCF11O94913 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
PCF11O94913 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
PCF11O94913 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
PCF11O94913 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
PCF11O94913 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
PCF11O94913 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
PCF11O94913 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
PCF11O94913 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
PCF11O94913 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42■■■■■ 4.31
PCF11O94913 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
PCF11O94913 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
PCF11O94913 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
PCF11O94913 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
PCF11O94913 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
PCF11O94913 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
PCF11O94913 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
PCF11O94913 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
PCF11O94913 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
PCF11O94913 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
PCF11O94913 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
PCF11O94913 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
PCF11O94913 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
PCF11O94913 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
PCF11O94913 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
PCF11O94913 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.88■■■■■ 4.3
PCF11O94913 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
PCF11O94913 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
PCF11O94913 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
PCF11O94913 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PCF11O94913 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
PCF11O94913 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
PCF11O94913 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
PCF11O94913 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
PCF11O94913 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms