Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX3O75364 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX3O75364 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITX3O75364 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX3O75364 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX3O75364 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX3O75364 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX3O75364 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX3O75364 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITX3O75364 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX3O75364 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX3O75364 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PITX3O75364 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX3O75364 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX3O75364 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX3O75364 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX3O75364 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PITX3O75364 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PITX3O75364 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PITX3O75364 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PITX3O75364 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX3O75364 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX3O75364 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX3O75364 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX3O75364 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PITX3O75364 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITX3O75364 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITX3O75364 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITX3O75364 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITX3O75364 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITX3O75364 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX3O75364 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX3O75364 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX3O75364 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX3O75364 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX3O75364 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX3O75364 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX3O75364 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX3O75364 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX3O75364 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITX3O75364 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITX3O75364 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX3O75364 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX3O75364 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX3O75364 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX3O75364 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX3O75364 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX3O75364 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX3O75364 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX3O75364 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX3O75364 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX3O75364 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX3O75364 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX3O75364 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX3O75364 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX3O75364 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX3O75364 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX3O75364 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX3O75364 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX3O75364 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX3O75364 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX3O75364 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX3O75364 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PITX3O75364 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX3O75364 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX3O75364 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX3O75364 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX3O75364 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX3O75364 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX3O75364 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX3O75364 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX3O75364 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX3O75364 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX3O75364 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX3O75364 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX3O75364 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX3O75364 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX3O75364 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX3O75364 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX3O75364 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX3O75364 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX3O75364 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX3O75364 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX3O75364 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX3O75364 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX3O75364 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX3O75364 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX3O75364 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX3O75364 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX3O75364 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX3O75364 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX3O75364 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX3O75364 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX3O75364 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX3O75364 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX3O75364 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX3O75364 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX3O75364 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX3O75364 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX3O75364 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms