Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH16O75309 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDH16O75309 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH16O75309 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH16O75309 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH16O75309 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH16O75309 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH16O75309 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH16O75309 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH16O75309 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH16O75309 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH16O75309 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH16O75309 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH16O75309 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH16O75309 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDH16O75309 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDH16O75309 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH16O75309 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH16O75309 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH16O75309 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH16O75309 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH16O75309 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH16O75309 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH16O75309 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH16O75309 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH16O75309 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH16O75309 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH16O75309 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH16O75309 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH16O75309 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH16O75309 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH16O75309 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH16O75309 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH16O75309 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH16O75309 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH16O75309 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH16O75309 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH16O75309 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH16O75309 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH16O75309 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH16O75309 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH16O75309 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH16O75309 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH16O75309 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH16O75309 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH16O75309 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH16O75309 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH16O75309 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH16O75309 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH16O75309 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH16O75309 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH16O75309 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH16O75309 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH16O75309 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH16O75309 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDH16O75309 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH16O75309 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH16O75309 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH16O75309 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH16O75309 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH16O75309 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH16O75309 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH16O75309 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH16O75309 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH16O75309 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDH16O75309 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDH16O75309 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH16O75309 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH16O75309 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH16O75309 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH16O75309 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH16O75309 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH16O75309 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH16O75309 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH16O75309 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH16O75309 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH16O75309 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH16O75309 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDH16O75309 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH16O75309 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH16O75309 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH16O75309 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH16O75309 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH16O75309 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH16O75309 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH16O75309 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH16O75309 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH16O75309 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH16O75309 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH16O75309 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH16O75309 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH16O75309 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH16O75309 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH16O75309 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH16O75309 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH16O75309 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH16O75309 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH16O75309 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH16O75309 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH16O75309 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms