Protein–RNA interactions for Protein: O70624

Myoc, Myocilin, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyocO70624 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MyocO70624 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MyocO70624 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MyocO70624 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MyocO70624 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MyocO70624 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MyocO70624 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MyocO70624 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MyocO70624 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MyocO70624 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MyocO70624 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MyocO70624 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MyocO70624 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MyocO70624 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MyocO70624 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MyocO70624 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MyocO70624 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MyocO70624 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MyocO70624 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MyocO70624 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MyocO70624 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MyocO70624 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MyocO70624 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MyocO70624 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MyocO70624 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MyocO70624 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MyocO70624 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MyocO70624 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MyocO70624 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MyocO70624 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MyocO70624 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MyocO70624 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MyocO70624 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MyocO70624 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MyocO70624 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MyocO70624 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MyocO70624 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MyocO70624 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MyocO70624 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MyocO70624 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MyocO70624 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
MyocO70624 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MyocO70624 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MyocO70624 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MyocO70624 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MyocO70624 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MyocO70624 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MyocO70624 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MyocO70624 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MyocO70624 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MyocO70624 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MyocO70624 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MyocO70624 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MyocO70624 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MyocO70624 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MyocO70624 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MyocO70624 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MyocO70624 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MyocO70624 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MyocO70624 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MyocO70624 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MyocO70624 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MyocO70624 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MyocO70624 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MyocO70624 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MyocO70624 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MyocO70624 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MyocO70624 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MyocO70624 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MyocO70624 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MyocO70624 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MyocO70624 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MyocO70624 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MyocO70624 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MyocO70624 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MyocO70624 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MyocO70624 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MyocO70624 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MyocO70624 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MyocO70624 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MyocO70624 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MyocO70624 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MyocO70624 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MyocO70624 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MyocO70624 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MyocO70624 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MyocO70624 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MyocO70624 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MyocO70624 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MyocO70624 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MyocO70624 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MyocO70624 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MyocO70624 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MyocO70624 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MyocO70624 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MyocO70624 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MyocO70624 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MyocO70624 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MyocO70624 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MyocO70624 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms