Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EdaO54693 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EdaO54693 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EdaO54693 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EdaO54693 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EdaO54693 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EdaO54693 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EdaO54693 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EdaO54693 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EdaO54693 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EdaO54693 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EdaO54693 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EdaO54693 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EdaO54693 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EdaO54693 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EdaO54693 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EdaO54693 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EdaO54693 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EdaO54693 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EdaO54693 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EdaO54693 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EdaO54693 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EdaO54693 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EdaO54693 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EdaO54693 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EdaO54693 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EdaO54693 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EdaO54693 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EdaO54693 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EdaO54693 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EdaO54693 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EdaO54693 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EdaO54693 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EdaO54693 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EdaO54693 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EdaO54693 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EdaO54693 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EdaO54693 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EdaO54693 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EdaO54693 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EdaO54693 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EdaO54693 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EdaO54693 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EdaO54693 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EdaO54693 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EdaO54693 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EdaO54693 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EdaO54693 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EdaO54693 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EdaO54693 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EdaO54693 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EdaO54693 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EdaO54693 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EdaO54693 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EdaO54693 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EdaO54693 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EdaO54693 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EdaO54693 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EdaO54693 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EdaO54693 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EdaO54693 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EdaO54693 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EdaO54693 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EdaO54693 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EdaO54693 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EdaO54693 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EdaO54693 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EdaO54693 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EdaO54693 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EdaO54693 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EdaO54693 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EdaO54693 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EdaO54693 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EdaO54693 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EdaO54693 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EdaO54693 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EdaO54693 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EdaO54693 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EdaO54693 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EdaO54693 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EdaO54693 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EdaO54693 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EdaO54693 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EdaO54693 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EdaO54693 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EdaO54693 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EdaO54693 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EdaO54693 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EdaO54693 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EdaO54693 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EdaO54693 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EdaO54693 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EdaO54693 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EdaO54693 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EdaO54693 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EdaO54693 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EdaO54693 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EdaO54693 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EdaO54693 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EdaO54693 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms