Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
EdaO54693 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
EdaO54693 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
EdaO54693 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
EdaO54693 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
EdaO54693 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
EdaO54693 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
EdaO54693 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
EdaO54693 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
EdaO54693 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
EdaO54693 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EdaO54693 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
EdaO54693 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EdaO54693 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
EdaO54693 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
EdaO54693 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
EdaO54693 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
EdaO54693 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
EdaO54693 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
EdaO54693 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EdaO54693 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EdaO54693 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
EdaO54693 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
EdaO54693 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
EdaO54693 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EdaO54693 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EdaO54693 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EdaO54693 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
EdaO54693 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EdaO54693 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EdaO54693 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EdaO54693 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EdaO54693 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EdaO54693 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EdaO54693 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EdaO54693 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EdaO54693 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EdaO54693 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
EdaO54693 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EdaO54693 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
EdaO54693 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EdaO54693 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EdaO54693 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
EdaO54693 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EdaO54693 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EdaO54693 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
EdaO54693 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EdaO54693 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EdaO54693 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
EdaO54693 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EdaO54693 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EdaO54693 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
EdaO54693 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EdaO54693 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EdaO54693 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EdaO54693 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EdaO54693 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EdaO54693 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EdaO54693 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EdaO54693 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
EdaO54693 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EdaO54693 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EdaO54693 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EdaO54693 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EdaO54693 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EdaO54693 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EdaO54693 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EdaO54693 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EdaO54693 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EdaO54693 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EdaO54693 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EdaO54693 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EdaO54693 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EdaO54693 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EdaO54693 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EdaO54693 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EdaO54693 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EdaO54693 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EdaO54693 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EdaO54693 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EdaO54693 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EdaO54693 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EdaO54693 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EdaO54693 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EdaO54693 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EdaO54693 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EdaO54693 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EdaO54693 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EdaO54693 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EdaO54693 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EdaO54693 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EdaO54693 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EdaO54693 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EdaO54693 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EdaO54693 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
EdaO54693 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EdaO54693 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EdaO54693 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EdaO54693 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EdaO54693 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms