Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT86O43790 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT86O43790 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT86O43790 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT86O43790 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT86O43790 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT86O43790 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT86O43790 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT86O43790 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT86O43790 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT86O43790 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT86O43790 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT86O43790 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT86O43790 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT86O43790 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT86O43790 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT86O43790 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT86O43790 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT86O43790 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT86O43790 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT86O43790 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT86O43790 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT86O43790 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT86O43790 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT86O43790 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT86O43790 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT86O43790 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT86O43790 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT86O43790 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT86O43790 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT86O43790 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT86O43790 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT86O43790 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT86O43790 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT86O43790 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT86O43790 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT86O43790 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT86O43790 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT86O43790 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT86O43790 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT86O43790 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT86O43790 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT86O43790 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT86O43790 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT86O43790 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT86O43790 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT86O43790 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT86O43790 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT86O43790 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT86O43790 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT86O43790 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT86O43790 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT86O43790 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT86O43790 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT86O43790 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT86O43790 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT86O43790 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT86O43790 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT86O43790 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT86O43790 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT86O43790 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT86O43790 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT86O43790 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT86O43790 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT86O43790 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT86O43790 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT86O43790 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT86O43790 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT86O43790 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT86O43790 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT86O43790 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT86O43790 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT86O43790 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT86O43790 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT86O43790 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT86O43790 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT86O43790 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT86O43790 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT86O43790 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT86O43790 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT86O43790 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT86O43790 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT86O43790 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT86O43790 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT86O43790 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT86O43790 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT86O43790 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT86O43790 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT86O43790 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT86O43790 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT86O43790 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT86O43790 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT86O43790 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT86O43790 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT86O43790 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT86O43790 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT86O43790 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT86O43790 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT86O43790 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT86O43790 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms