Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dsg3O35902 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dsg3O35902 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dsg3O35902 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dsg3O35902 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dsg3O35902 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dsg3O35902 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dsg3O35902 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dsg3O35902 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dsg3O35902 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dsg3O35902 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dsg3O35902 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dsg3O35902 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dsg3O35902 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dsg3O35902 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dsg3O35902 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dsg3O35902 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Dsg3O35902 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dsg3O35902 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dsg3O35902 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dsg3O35902 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dsg3O35902 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dsg3O35902 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dsg3O35902 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dsg3O35902 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dsg3O35902 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dsg3O35902 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Dsg3O35902 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dsg3O35902 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dsg3O35902 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dsg3O35902 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dsg3O35902 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dsg3O35902 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dsg3O35902 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dsg3O35902 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Dsg3O35902 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dsg3O35902 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dsg3O35902 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dsg3O35902 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dsg3O35902 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dsg3O35902 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dsg3O35902 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dsg3O35902 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dsg3O35902 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dsg3O35902 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dsg3O35902 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dsg3O35902 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dsg3O35902 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Dsg3O35902 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dsg3O35902 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dsg3O35902 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dsg3O35902 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dsg3O35902 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dsg3O35902 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dsg3O35902 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dsg3O35902 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dsg3O35902 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dsg3O35902 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dsg3O35902 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dsg3O35902 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dsg3O35902 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dsg3O35902 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dsg3O35902 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dsg3O35902 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dsg3O35902 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dsg3O35902 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Dsg3O35902 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dsg3O35902 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dsg3O35902 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dsg3O35902 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dsg3O35902 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dsg3O35902 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dsg3O35902 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dsg3O35902 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dsg3O35902 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dsg3O35902 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dsg3O35902 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dsg3O35902 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dsg3O35902 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dsg3O35902 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dsg3O35902 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dsg3O35902 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dsg3O35902 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dsg3O35902 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dsg3O35902 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms