Protein–RNA interactions for Protein: O15440

ABCC5, Multidrug resistance-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC5O15440 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ABCC5O15440 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ABCC5O15440 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
ABCC5O15440 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC5O15440 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC5O15440 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC5O15440 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC5O15440 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC5O15440 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ABCC5O15440 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ABCC5O15440 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ABCC5O15440 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
ABCC5O15440 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC5O15440 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ABCC5O15440 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ABCC5O15440 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ABCC5O15440 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ABCC5O15440 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ABCC5O15440 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
ABCC5O15440 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC5O15440 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC5O15440 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC5O15440 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC5O15440 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC5O15440 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC5O15440 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC5O15440 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC5O15440 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC5O15440 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
ABCC5O15440 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC5O15440 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC5O15440 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC5O15440 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
ABCC5O15440 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ABCC5O15440 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
ABCC5O15440 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
ABCC5O15440 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ABCC5O15440 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ABCC5O15440 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC5O15440 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC5O15440 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC5O15440 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC5O15440 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ABCC5O15440 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ABCC5O15440 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ABCC5O15440 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
ABCC5O15440 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ABCC5O15440 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
ABCC5O15440 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ABCC5O15440 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ABCC5O15440 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ABCC5O15440 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ABCC5O15440 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ABCC5O15440 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
ABCC5O15440 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.41■■■■■ 4.06
ABCC5O15440 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ABCC5O15440 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
ABCC5O15440 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC5O15440 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC5O15440 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
ABCC5O15440 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
ABCC5O15440 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
ABCC5O15440 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ABCC5O15440 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ABCC5O15440 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
ABCC5O15440 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.05
ABCC5O15440 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
ABCC5O15440 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC5O15440 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC5O15440 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC5O15440 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC5O15440 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ABCC5O15440 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
ABCC5O15440 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCC5O15440 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCC5O15440 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
ABCC5O15440 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCC5O15440 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCC5O15440 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCC5O15440 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ABCC5O15440 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ABCC5O15440 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCC5O15440 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC5O15440 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ABCC5O15440 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ABCC5O15440 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC5O15440 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC5O15440 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC5O15440 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC5O15440 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCC5O15440 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC5O15440 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC5O15440 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC5O15440 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC5O15440 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCC5O15440 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC5O15440 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC5O15440 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCC5O15440 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCC5O15440 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms