Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
J3QKU1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
J3QKU1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
J3QKU1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
J3QKU1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
J3QKU1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
J3QKU1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
J3QKU1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
J3QKU1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
J3QKU1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
J3QKU1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
J3QKU1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
J3QKU1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
J3QKU1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
J3QKU1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
J3QKU1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
J3QKU1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
J3QKU1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
J3QKU1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
J3QKU1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
J3QKU1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QKU1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QKU1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QKU1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QKU1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QKU1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QKU1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QKU1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QKU1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QKU1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QKU1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QKU1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QKU1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3QKU1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
J3QKU1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
J3QKU1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
J3QKU1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
J3QKU1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
J3QKU1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
J3QKU1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
J3QKU1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
J3QKU1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
J3QKU1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
J3QKU1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
J3QKU1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
J3QKU1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
J3QKU1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
J3QKU1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
J3QKU1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
J3QKU1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
J3QKU1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
J3QKU1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
J3QKU1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
J3QKU1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
J3QKU1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
J3QKU1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3QKU1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3QKU1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3QKU1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3QKU1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
J3QKU1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
J3QKU1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
J3QKU1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
J3QKU1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3QKU1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3QKU1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3QKU1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3QKU1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3QKU1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3QKU1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3QKU1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3QKU1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
J3QKU1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
J3QKU1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
J3QKU1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
J3QKU1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
J3QKU1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
J3QKU1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
J3QKU1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3QKU1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
J3QKU1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
J3QKU1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
J3QKU1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3QKU1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3QKU1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
J3QKU1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3QKU1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3QKU1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3QKU1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3QKU1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3QKU1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3QKU1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3QKU1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3QKU1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
J3QKU1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
J3QKU1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
J3QKU1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3QKU1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3QKU1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3QKU1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms