Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrp3E9Q1T6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp3E9Q1T6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp3E9Q1T6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrp3E9Q1T6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrp3E9Q1T6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrp3E9Q1T6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrp3E9Q1T6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrp3E9Q1T6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrp3E9Q1T6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrp3E9Q1T6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrp3E9Q1T6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrp3E9Q1T6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrp3E9Q1T6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrp3E9Q1T6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrp3E9Q1T6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrp3E9Q1T6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrp3E9Q1T6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrp3E9Q1T6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrp3E9Q1T6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrp3E9Q1T6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrp3E9Q1T6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrp3E9Q1T6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrp3E9Q1T6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrp3E9Q1T6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrp3E9Q1T6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrp3E9Q1T6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrp3E9Q1T6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrp3E9Q1T6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrp3E9Q1T6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrp3E9Q1T6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp3E9Q1T6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp3E9Q1T6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp3E9Q1T6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp3E9Q1T6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp3E9Q1T6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp3E9Q1T6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp3E9Q1T6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp3E9Q1T6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp3E9Q1T6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp3E9Q1T6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp3E9Q1T6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp3E9Q1T6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp3E9Q1T6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp3E9Q1T6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp3E9Q1T6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrp3E9Q1T6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrp3E9Q1T6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrp3E9Q1T6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrp3E9Q1T6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrp3E9Q1T6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrp3E9Q1T6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrp3E9Q1T6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrp3E9Q1T6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrp3E9Q1T6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrp3E9Q1T6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrp3E9Q1T6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrp3E9Q1T6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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