Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Lrp3E9Q1T6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lrp3E9Q1T6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lrp3E9Q1T6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Lrp3E9Q1T6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Lrp3E9Q1T6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lrp3E9Q1T6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lrp3E9Q1T6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lrp3E9Q1T6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Lrp3E9Q1T6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Lrp3E9Q1T6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrp3E9Q1T6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Lrp3E9Q1T6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrp3E9Q1T6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrp3E9Q1T6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrp3E9Q1T6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrp3E9Q1T6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrp3E9Q1T6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrp3E9Q1T6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrp3E9Q1T6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrp3E9Q1T6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrp3E9Q1T6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrp3E9Q1T6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrp3E9Q1T6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrp3E9Q1T6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrp3E9Q1T6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrp3E9Q1T6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrp3E9Q1T6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrp3E9Q1T6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrp3E9Q1T6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrp3E9Q1T6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrp3E9Q1T6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrp3E9Q1T6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrp3E9Q1T6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrp3E9Q1T6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrp3E9Q1T6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrp3E9Q1T6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrp3E9Q1T6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrp3E9Q1T6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrp3E9Q1T6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrp3E9Q1T6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrp3E9Q1T6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Lrp3E9Q1T6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrp3E9Q1T6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrp3E9Q1T6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrp3E9Q1T6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrp3E9Q1T6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrp3E9Q1T6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrp3E9Q1T6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrp3E9Q1T6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrp3E9Q1T6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrp3E9Q1T6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrp3E9Q1T6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrp3E9Q1T6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrp3E9Q1T6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrp3E9Q1T6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrp3E9Q1T6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrp3E9Q1T6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrp3E9Q1T6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrp3E9Q1T6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lrp3E9Q1T6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrp3E9Q1T6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrp3E9Q1T6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrp3E9Q1T6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrp3E9Q1T6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrp3E9Q1T6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrp3E9Q1T6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrp3E9Q1T6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrp3E9Q1T6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Lrp3E9Q1T6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrp3E9Q1T6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrp3E9Q1T6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrp3E9Q1T6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrp3E9Q1T6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrp3E9Q1T6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrp3E9Q1T6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrp3E9Q1T6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrp3E9Q1T6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrp3E9Q1T6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrp3E9Q1T6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrp3E9Q1T6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrp3E9Q1T6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrp3E9Q1T6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrp3E9Q1T6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrp3E9Q1T6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrp3E9Q1T6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrp3E9Q1T6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrp3E9Q1T6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrp3E9Q1T6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrp3E9Q1T6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrp3E9Q1T6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrp3E9Q1T6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrp3E9Q1T6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrp3E9Q1T6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrp3E9Q1T6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lrp3E9Q1T6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrp3E9Q1T6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrp3E9Q1T6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
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