Protein–RNA interactions for Protein: D6RGX4

FAM90A26, Family with sequence similarity 90 member A26, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A26D6RGX4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM90A26D6RGX4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM90A26D6RGX4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM90A26D6RGX4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM90A26D6RGX4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM90A26D6RGX4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM90A26D6RGX4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM90A26D6RGX4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM90A26D6RGX4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM90A26D6RGX4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM90A26D6RGX4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM90A26D6RGX4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM90A26D6RGX4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM90A26D6RGX4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM90A26D6RGX4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM90A26D6RGX4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM90A26D6RGX4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM90A26D6RGX4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM90A26D6RGX4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM90A26D6RGX4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM90A26D6RGX4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM90A26D6RGX4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM90A26D6RGX4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM90A26D6RGX4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM90A26D6RGX4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM90A26D6RGX4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM90A26D6RGX4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM90A26D6RGX4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms