Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
RTL1A6NKG5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RTL1A6NKG5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RTL1A6NKG5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RTL1A6NKG5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RTL1A6NKG5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RTL1A6NKG5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RTL1A6NKG5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RTL1A6NKG5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RTL1A6NKG5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RTL1A6NKG5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RTL1A6NKG5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
RTL1A6NKG5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
RTL1A6NKG5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RTL1A6NKG5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RTL1A6NKG5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RTL1A6NKG5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RTL1A6NKG5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RTL1A6NKG5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
RTL1A6NKG5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
RTL1A6NKG5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RTL1A6NKG5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RTL1A6NKG5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RTL1A6NKG5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RTL1A6NKG5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RTL1A6NKG5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
RTL1A6NKG5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RTL1A6NKG5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RTL1A6NKG5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
RTL1A6NKG5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RTL1A6NKG5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
RTL1A6NKG5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RTL1A6NKG5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RTL1A6NKG5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RTL1A6NKG5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RTL1A6NKG5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RTL1A6NKG5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RTL1A6NKG5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RTL1A6NKG5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RTL1A6NKG5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RTL1A6NKG5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RTL1A6NKG5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RTL1A6NKG5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RTL1A6NKG5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RTL1A6NKG5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RTL1A6NKG5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RTL1A6NKG5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RTL1A6NKG5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RTL1A6NKG5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RTL1A6NKG5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RTL1A6NKG5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RTL1A6NKG5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RTL1A6NKG5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RTL1A6NKG5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RTL1A6NKG5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RTL1A6NKG5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RTL1A6NKG5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RTL1A6NKG5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RTL1A6NKG5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RTL1A6NKG5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RTL1A6NKG5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RTL1A6NKG5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
RTL1A6NKG5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
RTL1A6NKG5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
RTL1A6NKG5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RTL1A6NKG5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
RTL1A6NKG5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RTL1A6NKG5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RTL1A6NKG5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
RTL1A6NKG5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RTL1A6NKG5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RTL1A6NKG5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RTL1A6NKG5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RTL1A6NKG5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RTL1A6NKG5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RTL1A6NKG5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RTL1A6NKG5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RTL1A6NKG5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RTL1A6NKG5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RTL1A6NKG5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RTL1A6NKG5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
RTL1A6NKG5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RTL1A6NKG5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RTL1A6NKG5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms