Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLTPD2A6NH11 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLTPD2A6NH11 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GLTPD2A6NH11 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GLTPD2A6NH11 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GLTPD2A6NH11 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GLTPD2A6NH11 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GLTPD2A6NH11 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GLTPD2A6NH11 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GLTPD2A6NH11 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GLTPD2A6NH11 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GLTPD2A6NH11 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GLTPD2A6NH11 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GLTPD2A6NH11 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
GLTPD2A6NH11 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
GLTPD2A6NH11 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
GLTPD2A6NH11 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GLTPD2A6NH11 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GLTPD2A6NH11 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GLTPD2A6NH11 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GLTPD2A6NH11 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GLTPD2A6NH11 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GLTPD2A6NH11 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
GLTPD2A6NH11 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GLTPD2A6NH11 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
GLTPD2A6NH11 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GLTPD2A6NH11 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GLTPD2A6NH11 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
GLTPD2A6NH11 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GLTPD2A6NH11 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GLTPD2A6NH11 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GLTPD2A6NH11 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GLTPD2A6NH11 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GLTPD2A6NH11 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GLTPD2A6NH11 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GLTPD2A6NH11 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GLTPD2A6NH11 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GLTPD2A6NH11 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GLTPD2A6NH11 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GLTPD2A6NH11 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GLTPD2A6NH11 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GLTPD2A6NH11 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GLTPD2A6NH11 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GLTPD2A6NH11 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GLTPD2A6NH11 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLTPD2A6NH11 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GLTPD2A6NH11 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLTPD2A6NH11 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLTPD2A6NH11 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLTPD2A6NH11 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLTPD2A6NH11 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLTPD2A6NH11 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLTPD2A6NH11 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLTPD2A6NH11 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GLTPD2A6NH11 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GLTPD2A6NH11 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GLTPD2A6NH11 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
GLTPD2A6NH11 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
GLTPD2A6NH11 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GLTPD2A6NH11 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GLTPD2A6NH11 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GLTPD2A6NH11 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GLTPD2A6NH11 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GLTPD2A6NH11 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms