Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC160A6NGH7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC160A6NGH7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC160A6NGH7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC160A6NGH7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC160A6NGH7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC160A6NGH7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC160A6NGH7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC160A6NGH7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC160A6NGH7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC160A6NGH7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC160A6NGH7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC160A6NGH7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC160A6NGH7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC160A6NGH7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC160A6NGH7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC160A6NGH7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC160A6NGH7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC160A6NGH7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC160A6NGH7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC160A6NGH7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC160A6NGH7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC160A6NGH7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC160A6NGH7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC160A6NGH7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC160A6NGH7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC160A6NGH7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC160A6NGH7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC160A6NGH7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC160A6NGH7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC160A6NGH7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC160A6NGH7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC160A6NGH7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC160A6NGH7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC160A6NGH7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC160A6NGH7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC160A6NGH7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC160A6NGH7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC160A6NGH7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC160A6NGH7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC160A6NGH7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC160A6NGH7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC160A6NGH7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms