Protein–RNA interactions for Protein: A6NFC5

TMEM235, Transmembrane protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM235A6NFC5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM235A6NFC5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM235A6NFC5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM235A6NFC5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM235A6NFC5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM235A6NFC5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM235A6NFC5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM235A6NFC5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM235A6NFC5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM235A6NFC5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM235A6NFC5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM235A6NFC5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM235A6NFC5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM235A6NFC5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM235A6NFC5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM235A6NFC5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM235A6NFC5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM235A6NFC5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM235A6NFC5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM235A6NFC5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM235A6NFC5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM235A6NFC5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM235A6NFC5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM235A6NFC5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms