Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP46

BC034090, cDNA sequence BC034090, mousemouse

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Length 1,202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC034090A0A087WP46 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BC034090A0A087WP46 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BC034090A0A087WP46 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC034090A0A087WP46 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC034090A0A087WP46 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC034090A0A087WP46 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC034090A0A087WP46 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC034090A0A087WP46 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC034090A0A087WP46 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC034090A0A087WP46 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC034090A0A087WP46 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BC034090A0A087WP46 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC034090A0A087WP46 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BC034090A0A087WP46 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BC034090A0A087WP46 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BC034090A0A087WP46 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC034090A0A087WP46 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC034090A0A087WP46 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC034090A0A087WP46 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BC034090A0A087WP46 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BC034090A0A087WP46 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC034090A0A087WP46 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BC034090A0A087WP46 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC034090A0A087WP46 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC034090A0A087WP46 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC034090A0A087WP46 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BC034090A0A087WP46 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC034090A0A087WP46 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC034090A0A087WP46 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC034090A0A087WP46 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC034090A0A087WP46 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BC034090A0A087WP46 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC034090A0A087WP46 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC034090A0A087WP46 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC034090A0A087WP46 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC034090A0A087WP46 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC034090A0A087WP46 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC034090A0A087WP46 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BC034090A0A087WP46 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC034090A0A087WP46 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC034090A0A087WP46 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC034090A0A087WP46 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC034090A0A087WP46 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC034090A0A087WP46 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC034090A0A087WP46 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC034090A0A087WP46 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC034090A0A087WP46 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC034090A0A087WP46 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC034090A0A087WP46 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC034090A0A087WP46 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC034090A0A087WP46 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC034090A0A087WP46 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC034090A0A087WP46 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC034090A0A087WP46 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms