Protein–RNA interactions for Protein: S4R3C0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3C0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
S4R3C0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
S4R3C0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
S4R3C0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
S4R3C0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S4R3C0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S4R3C0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S4R3C0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S4R3C0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S4R3C0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
S4R3C0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
S4R3C0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
S4R3C0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
S4R3C0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
S4R3C0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
S4R3C0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
S4R3C0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
S4R3C0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
S4R3C0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms