Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TSSC4Q9Y5U2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSSC4Q9Y5U2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms