Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO3Q9Y5L0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNPO3Q9Y5L0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms