Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms