Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAXBP1Q9Y5B6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms