Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NRXN3Q9Y4C0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN3Q9Y4C0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms