Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms