Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GIT1Q9Y2X7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIT1Q9Y2X7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIT1Q9Y2X7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GIT1Q9Y2X7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIT1Q9Y2X7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIT1Q9Y2X7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIT1Q9Y2X7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIT1Q9Y2X7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIT1Q9Y2X7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIT1Q9Y2X7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIT1Q9Y2X7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIT1Q9Y2X7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIT1Q9Y2X7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIT1Q9Y2X7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIT1Q9Y2X7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIT1Q9Y2X7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms