Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAN1Q9Y2M0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms