Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOD1Q9Y239 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOD1Q9Y239 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms