Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms