Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVW-1Q9UQF0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVW-1Q9UQF0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVW-1Q9UQF0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVW-1Q9UQF0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVW-1Q9UQF0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVW-1Q9UQF0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVW-1Q9UQF0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVW-1Q9UQF0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVW-1Q9UQF0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVW-1Q9UQF0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVW-1Q9UQF0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVW-1Q9UQF0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVW-1Q9UQF0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms