Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG5Q9UPR3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms