Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHF8Q9UPP1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms