Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCAF8Q9UPN6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms