Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms