Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD4Q9ULV1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms