Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms