Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL4Q9UJQ4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms