Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAI1Q9UI46 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAI1Q9UI46 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms