Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF20Q9UGU0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms