Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5BQ9UGL1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
KDM5BQ9UGL1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM5BQ9UGL1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms